טיוטה:מאגר המידע הגנומי GOLD
מאגר מידע לגנומים GOLD (Genomes OnLine Database) הינו משאב אינטרנטי להשוואת מידע של מיזמי ריצוף גנומי ומטאגנומי, ומטא דאטה הנלווה אליהם[1]. מאגר המידע GOLD נוצר בשנת 1997; הגרסה הראשונה של מאגר הנתונים הכילה מידע מ350 מיזמי ריצוף, שמתוכם 48 רוצפו במלואם ופורסמו עם ניתוח המידע שלהם[1].
הגרסה החמישית של GOLD פורסמה ב28 למאי 2014. ב5 לאוגוסט 2015, מאגר GOLD מכיל מידע מ67,879 מיזמי ריצוף, שמתוכם 7,210 הושלמו[2]. מלבד הDOE JGI, שלושת תורמי המידע הגדולים למאגרGOLD הם הBroad Institute, J.Craig Venter Intitute, University of MarylandSchill of Medicine.שגיאת ציטוט: תג <ref> לא תקין; להערות שוליים ללא שם חייב להיות תוכןhttps://gold.jgi.doe.gov/statistics
ח משווה בין המידע במאגר GOLD לבין מאגרי מידע אחרים (למשל GeneBank and EMBL( , GOLD , מיישם את מפרט minimum information standard metadata המומלץ על ידי GSC, ובמיוחד את מפרט ה - MIxs )Minimum Information about any (x) Sequence) .[2]GOLD מאפשר בנוסף לערוך הגהה לגנום או מטאגנום הנעזרים בDOE JGI Integrated Microbial Genomes System ומכיל קישורים לכתב העת BioMed Central, Standards in Genomic Sciences, המאפשר לפרסם מידע מטאגנומי[2] (2,4).enomic Sciences, המאפשר לפרסם מידע מטאגנומי.[2][3]
ראו גם[עריכת קוד מקור | עריכה]
MicrobesOnline
הערות שוליים[עריכת קוד מקור | עריכה]
- ^ 1 2 Kyrpides NC (September 1999). "Genomes OnLine Database (GOLD 1.0): a monitor of complete and ongoing genome projects world-wide". Bioinformatics. 15 (9): 773–4. doi:10.https://academic.oup.com/bioinformatics/article/15/9/773/229495. PMID 10498782.
- ^ 1 2 3 4 Reddy, T. B. K.; Thomas, A. D.; Stamatis, D.; Bertsch, J.; Isbandi, M.; Jansson, J.; Mallajosyula, J.; Pagani, I.; Lobos, E. A.; Kyrpides, N. C. (27 October 2014). "The Genomes OnLine Database (GOLD) v.5: a metadata management system based on a four level (meta)genome project classification". Nucleic Acids Research. 43 (D1): D1099–D1106. doi:10.1093/nar/gku950. PMC 4384021. PMID 25348402.
- ^ "JGI GOLD - Home". Retrieved 5 August 2015.